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casotti raffaellaRicercatore
Dipartimento di Ecologia Marina Integrata

Tel. +39 081 5833235
Fax: +39 081 7641355
e-mail: raffaella.casotti(at)szn.it
Contatto Skype: raffaella.casotti


Curriculum Vitae

Interessi di ricerca

Negli ultimi anni ho indagato gli effetti di metaboliti secondari prodotti dalle diatomee su organismi planctonici, inclusi diatomee e batteri. Mi sono concentrata sulle aldeidi poliinsature (PUA) che sono utilizzate dalle diatomee per inibire i loro principali predatori, i copepodi. Ho testato le PUA su altre alghe fitoplanctoniche e su batteri e ho scoperto che queste innescano un percorso di segnalazione di stress molto sofisticato che coinvolge NO e ROS in funzione della concentrazione di PUA.
Questo ha forti implicazioni sull’ecologia delle zone costiere, dove le diatomee sono presenti in quantità elevate soprattutto durante le fioriture tardo-invernali. Durante tali fioriture, le PUA possono agire come determinanti e modulatori di composizione della comunità e anche regolare lo sviluppo e il destino dell fioritura.
Essendo un’ecologa marina di formazione, il mio interesse è quello di testare le ipotesi sul funzionamento delle PUA in mare, e per questo motivo, ho partecipato a diverse crociere di ricerca volte a valutare le concentrazioni PUA in mare, i tassi di lisi e i loro possibili effetti in situ.
Il mio strumento principale di ricerca è la citometria a flusso, sia in laboratorio che in mare durante campagne oceanografiche. Tuttavia, più di recente, ho usato diverse tecniche molecolari come CARD-FISH da sola o insieme alla Microautoradiografia e la metagenomica per approfondire la diversità e la funzionalità dei batteri eterotrofi nel Golfo di Napoli. Allo stesso tempo, mi interesso delle applicazioni innovative della citometria a flusso usando sorter cellulari ad alta resa accoppiati con metodi molecolari e citometri a flusso prototipali come strumenti per il monitoraggio marino della qualità delle acque.

Principali Pubblicazioni

*corresponding author

*Casotti R, Mazza S, Brunet C, Vantrepotte V, Ianora A, Miralto A. (2005) Growth autoinhibition and genotoxicity of the diatom aldehyde 2-trans-4-trans decadienal on Thalassiosira weissflogii (Bacillariophyceae). J. Phycol. 41: 7-20.

Vardi, A., F. Formiggini, R. Casotti, A. de Martino, F. Ribalet, A. Miralto and C. Bowler (2006) A stress surveillance system based on calcium and nitric oxide in marine diatoms. PLoS Biology 4(3): 1-9.

*Ribalet F, Intertaglia L, Lebaron P, Casotti R. (2008) Differential effect of three polyunsaturated aldehydes on the growth of thirty three marine bacterial strains. Aquatic Toxicology 86: 249-255

*Ribalet F., Vidoudez C., Cassin, D., Pohnert G., Ianora A., Miralto A., and Casotti R. (2009) High plasticity in the production of diatom-derived polyunsaturated aldehydes under nutrient limitation: Physiological and ecological implications. Protist 160(3): 444-451 doi 10.106/j.protis.2009.01.003

*Balestra C., Alonso-Saez L., Gasol J. M., Casotti R. (2011) Group-specific effects on coastal bacterioplankton of polyunsaturated aldehydes produced by diatoms. Aquatic Microbial Ecology 63: 123-131

*Ribalet F., Bastianini M., Vidoudez C., Acri F., Berges J., Ianora A., Miralto A., Pohnert G., Romano G., Wichard T, Casotti R. (2014). Phytoplankton Cell Lysis Associated with Polyunsaturated Aldehyde Release in the Northern Adriatic Sea. PLoS One 9(1): e85947. doi:10.1371/journal.pone.0085947

Villar E., Farrant G., Follows M., Garczarek L., Speich S. Audic S., Bittner L., Blanke B., Brum J.R., Brunet C., Casotti R., Chase A., Dolan J.R., d'Ortenzio F., Gattuso J-P., Nicolas Grima, Lionel Guidi, Christopher N. Hill, Oliver Jahn, Jean-Louis Jamet, Hervé Le Goff, Cyrille Lepoivre, Shruti Malviya, Eric Pelletier, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Sébastien Santini, Eleonora Scalco, Sarah M. Schwenck, Atsuko Tanaka, Pierre Testor, Thomas Vannier, Flora Vincent, Adriana Zingone, Céline Dimier, Marc Picheral, Sarah Searson, Stefanie Kandels-Lewis, Tara Oceans coordinators, Silvia G. Acinas, Peer Bork17, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Gabriel Gorsky, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker, Karsenti E., Bowler C., Not F., Hingamp P., Iudicone D. (2015). Environmental characteristics of Agulhas rings affect inter-ocean plankton transport. Science 348(6237) doi: 10.1126/science.1261447

*Gallina A., Palumbo A., Casotti R. Oxidative pathways in response to polyunsaturated aldehydes in the marine diatom Skeletonema marinoi (Bacillariophyceae) J. Phycology (2016) 52(4):590-598; DOI: 10.1111/jpy.12421

*Thiele S., Richter M., Balestra C., Glockner F-O, Casotti R. (2017). Taxonomic and functional diversity of a coastal planktonic bacterial community in a river-influenced marine area. Marine Genomics 32:61-69

*Pepi M., Heipieper H.J., Balestra C., Borra M., Biffali E., Casotti R. Toxicity of diatom polyunsaturated aldehydes to marine bacterial isolates reveals their enormous potential as contact poisons (2017) Chemosphere 177: 258-265

*Richa K., Balestra C., Piredda R., Benes V., Borra M., Passarelli A., Margiotta F., Saggiomo M., Biffali E., Sanges R., Scanlan DJ., Casotti R. (2017) Distribution, community composition and potential metabolic activity of bacterioplankton in an urbanized Mediterranean Sea coastal zone. Applied and Environmental Microbiology 83(17):1-17 83:e00494-17.

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