The Summer School Schmid Training Course "Established and Emerging Model Organisms for Marine Science" will take place at the Stazione Zoologica Dohrn Napoli (SZN) from the 24th of May to the 4th of June, 2021. Please have a look to the Flyer Summer School.
The Summer School is dedicated to 20 Master students and 1^st year PhD students who will learn about several marine organisms used in biological research, and will include lessons (interactive talks) and bench experiments to give the possibility to learn many aspects of the life cycle, embryology, anatomy, evolution, regeneration, genetics, neuroscience thanks to the presence of world experts of the field.
Interested candidates should send the CV and a motivation letter to the Organizers: Salvatore D’Aniello <Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.> and Agnes Boutet <Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.>.

The Summer School is funded by the Erasmus+ DigitalMarine project (2018-2021)

Innovative and interdisciplinary teaching and research training method

The DigitalMarine project is the fruit of a strategic partnership funded by the European Union Erasmus+ programme and consists of an online distance-learning platform focusing on marine model organisms in life sciences. Master's students of six European Universities and Marine Research Institutions* are provided with video lectures, interviews with researchers, virtual labs and scientific literature to provide a more autonomous and differentiated learning experience. This international research training constitutes of a hybrid teaching combining self-learning and practical lab work. DigitalMarine aims to enrich the annual practical marine biology Schmid Training Course in Roscoff (France) using a broad range of organisms: acoels, annelids, brown algae, cephalochordates, cnidarians, crustaceans, echinoderms, placozoans, poriferans, sharks, urochordates. In 2021 it has been held at the Stazione Zoologica Dohrn in Naples (Italy), one of the partner Institutions.For more information visit: https://digital-marine.sorbonne-universite.fr/index.php/digitalmarine

* Partner list

Sorbonne Université, Coordinator (Paris, France) & Station Biologique de Roscoff (France)

Stazione Zoologica Anton Dohrn (Naples, Italy)

Tierärztlich Hochschule Hannover (Germany)

Université de Fribourg (Switzerland)

Universtà del Salento (Lecce, Italy)

The Australian National University (Canberra, Australia)

Biologia ed Evoluzione degli Organismi Marini (BEOM):

• Titolo: Plasticità comportamentale in Octopus vulgaris
  Tutor SZN: Graziano Fiorito
  Dipartimento: BEOM

Descrizione:

Descrizione: Analisi della capacità di risoluzione di problemi nel polpo comune anche sulla base di dati storici di performance comportamentale. Variazioni interindividuali nell'apprendimento contestuale.

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• Titolo: Sviluppo di un atlante digitale del cervello di Octopus vulgaris
  Tutor SZN: Graziano Fiorito
  Dipartimento: BEOM

Descrizione:

Sulla base dell'analisi di studi pubblicati e di risorse interne (disponibili presso l'octopus lab, Dipartimento Biologia ed Evoluzione degli Organismi Marini - BEOM, Stazione Zoologica) si prevede di sviluppare l'annotazione di sezioni seriali dell'intero cervello di polpo adulto, integrando dati sulla struttura ed organizzazione neurale, con rappresentazione digitale delle singole aree e regioni di interesse. Il prodotto atteso prevede applicazione dei principi FAA (flexible annotation atlas) e implementazione dei FAIR Data Principles. Il contributo finale atteso aiuterà a migliorare la coerenza della definizione di regioni di interesse dell'intero cervello di cefalopodi tra i laboratori a livello internazionale.

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Ecologia Marina Integrata (EMI):

• Titolo: Habitat Mapping del Canyon Dohrn: analisi Ecologica e cartografia dei fondali
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento EMI

Descrizione

Il Canyon Dohrn, situato nel Golfo di Napoli, rappresenta una profonda incisione perpendicolare alla costa che raggiunge circa 1200 metri di profondità. Il Canyon Dohrn ospita una comunità animale di estremo interesse scientifico e conservazionistico, quali i coralli bianchi, grande ostriche centenarie e altre specie ritenute rare in tutto il bacino mediterraneo, nonostante sia soggetto a numerosi impatti antropici.

L'obiettivo principale della tesi è la caratterizzazione degli habitat bentonici del Canyon Dohrn attraverso tecniche di habitat mapping. Lo scopo di quello di ricreare una mappa ad alta risoluzione degli habitat bentonici del Canyon Dohrn, evidenziando le relazioni tra la morfologia del fondale, impatti e la distribuzione delle specie. Inoltre, l'analisi contribuirà alla definizione di strategie di gestione sostenibile dell'area, supportando eventuali proposte di protezione.

Questo studio si inserisce nel contesto del progetto Life Dream: Deep REef restoration And litter removal in the Mediterranean sea, volto alla protezione e al ripristino degli habitat profondi.

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• Titolo: Biodiversità associata ai mouds profondi del Mediterraneo Centrale
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Lo studio si propone di investigare la diversità biologica associata ai mounds sottomarini del Mediterraneo Centrale. Queste strutture geomorfologiche rappresentano habitat profondi unici, che spesso ospitano ecosistemi complessi e diversificati. Nonostante la loro importanza ecologica, rimangono in gran parte inesplorate. . Il progetto di ricerca avrà come obiettivo principale l'analisi dei video raccolti mediante ROV, integrando i risultati con l'analisi di campioni biologici precedentemente prelevati. Lo studente esaminerà le specie presenti e valuterà la loro distribuzione e abbondanza.

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• Titolo: Megabenthos di acque profonde del Mediterraneo Centrale
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Lo studio mira a creare un inventario della fauna megabentonica profonda del Mediterraneo Centrale, combinando l'analisi video con l'approccio morfologico/molecolare del materiale campionato

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• Titolo: Monitoraggio di microcosmi in ambiente controllato
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI
  
  Descrizione:

La ricerca mira a valutare le prestazioni di allevamento in acquario di "minicomunità" mediante il monitoraggio a medio termine dei parametri morfometrici.

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• Titolo: Gestione dei rifiuti negli ecosistemi marini profondi
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Sebbene gli ecosistemi marini profondi siano riconosciuti come hot spot di biodiversità con ruoli funzionali rilevanti su tutto l’ecosistema marino, le recenti attività di mappatura hanno evidenziato un rilevante impatto dei rifiuti marini su di essi, con conseguenze importanti ma ancora sottovalutate in termini di perdita di habitat. Attualmente mancano protocolli standardizzati e “migliori pratiche” in grado di guidare i processi decisionali su come e quando affrontare questo impatto antropico, in termini di tecniche di rimozione e ripristino. La tesi di laurea si concentrerà sullo sviluppo dell’impalcatura di base per la creazione di metodologie standardizzate per la rimozione dei rifiuti marini negli habitat marini di acqua fredda. Il lavoro inizierà con una revisione sistematica della letteratura esistente, le leggi e le regolamentazioni pertinenti, nonché delle esperienze in corso in questo campo, rappresentando il primo passo per la definizione del nuovo protocollo e delle conseguenti migliori pratiche. Successivamente, verrà selezionato un “caso studio” nel contesto del progetto LIFEDREAMS (https://www.life-dream.eu/) per valutare la fattibilità delle procedure proposte. L’argomento oggetto della tesi è originale, innovativo e offrirà ampie opportunità per alimentare il dibattito scientifico.

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• Titolo: Risposte di comunità in contesti di multiple stressors
  Tutor SZN: Manuel Berlino, Maria Cristina Mangano
  Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione:

Gli habitat bentonici presentano un’elevata biodiversità, un attributo che li rende punti centrali del flusso di energia e del ciclo del carbonio. Sfortunatamente, le dinamiche del metabolismo nei vari ecosistemi e comunità sono poco conosciute, in particolare in funzione della biodiversità associata (cambiamenti/perdita) e della funzionalità. Lo scopo di questo lavoro è misurare il metabolismo in situ e raccogliere/misurare variabili comunitarie e abiotiche provenienti da diversi ecosistemi. Pertanto, essere in grado di comprendere il metabolismo della comunità attraverso la diversa composizione degli habitat, le funzioni dell'ecosistema e la presenza di diversi fattori di stress. Profilo: Laurea in scienze biologiche/ambientali/naturali o equivalente; Conoscenza della lingua inglese; Comprovata esperienza nel lavoro sul campo (marino); Comprovata esperienza in laboratorio (scienze biologiche); Certificato di immersione(?); Conoscenza dei cicli biogeochimici negli ambienti marini; Disponibilità a recarsi sul campo quando necessario; Competenze di base di Microsoft Office; Capacità di lavorare in gruppo e disponibilità ad apprendere. Le attività consisteranno nel fornire supporto durante le diverse fasi della ricerca: lavoro sul campo (misurazioni del metabolismo di diversi cicli giornalieri, valutazione della biodiversità e delle variabili abiotiche in diversi ecosistemi), elaborazione di campioni in laboratorio ed estrazione dei dati.

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• Titolo: I metaboliti di specie algali invasive: effetti diretti e indiretti e potenziali output applicativi
  Tutor SZN: Mirko Mutalipassi
  Dipertimento: EMI (NA)

Descrizione:

Il progetto di tesi sperimentale si concentra sull'analisi dei metaboliti di macroalghe marine considerate "aliene" e sui loro impatti su vertebrati e invertebrati in ambienti marini. L'obiettivo primario va oltre la semplice caratterizzazione e identificazione dei metaboliti chiave, ponendo enfasi sulla comprensione del loro ruolo ecologico, nonché sugli effetti diretti e indiretti che questi composti possono avere sugli organismi marini, influenzando dinamiche di predazione, competizione e l'intera rete trofica.
La ricerca si propone inoltre di valutare le possibili applicazioni di tali metaboliti, aprendo nuove prospettive per lo sfruttamento sostenibile di queste straordinarie risorse marine. Questo studio contribuirà a una maggiore comprensione dell'ecologia marina e delle potenziali implicazioni per la gestione e la conservazione degli ecosistemi costieri.

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• Titolo: Le spugne marine come produttori di metaboliti attivi: ruolo ecologico e applicazioni
  Tutor SZN: Mirko Mutalipassi
  Dipertimento: EMI (NA)

Descrizione:

Il progetto di tesi sperimentale costituisce un'indagine approfondita sul profilo metabolico di spugne marine specifiche, con particolare attenzione alle spugne marine classificate come "aliene," esplorando il loro potenziale come fonte di composti antifouling. L'obiettivo primario è condurre una caratterizzazione completa e identificare i metaboliti con funzioni rilevanti, oltre a studiare in dettaglio il loro impatto sulle diverse fasi di formazione delle incrostazioni marine. Attraverso  attività sperimentali, ci proponiamo di comprendere come questi metaboliti possano influenzare le prime fasi del fouling, legate alle attività batteriche e microalgali, nonché le fasi successive coinvolgenti macrofoulers come mitili e ascidie. Questa ricerca mira a massimizzare l'impiego di specie marine considerate aliene come fonte di molecole con potenziale applicazione nelle biotecnologie, con particolare riferimento al settore dell'antifouling.

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• Titolo: Studi di tassonomia integrata in invertebrati marini
  Tutor SZN: Laura Nunez Pons
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Ricerca basata nella classificazione degli invertebrati marini applicando tecniche per la diagnosi e descrizione morfologica delle specie, e approcci molecolari di DNA barcoding e filogenesi.

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• Titolo: Allelopatia e simbiosi funzionale in olobioti marini
  Tutor SZN: Laura Nunez Pons
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Studi relazionati con le interazioni simbiotiche negli ecosistemi marini e suo ruolo nella salute degli organismi, le malattie e l’acclimatazione a cambiamenti ambientali attraverso flussi metabolici di nutrienti, composti di difesa e mediatori allelochimici.

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• Titolo: Biologia di stadi larvali e giovanili di pesci nel Tirreno centro-meridionale
  Tutor SZN: Lorenzo Ciannelli
  Dipertimento: EMI, Sede Ischia (NA)

Descrizione:

Gli stadi precoci (uova, larve e giovanili) del ciclo vitale dei pesci hanno alti tassi di mortalità che influenzano le dinamiche di popolazione degli stadi adulti. Per molte specie commerciali del Tirreno centro-meridionale non si ha conoscenza delle zone di riproduzione e dei processi bio-fisici che ne influenzano il trasporto con le correnti e la sopravvivenza di uova e larve di pesci. Lo scopo di questo studio è quello di caratterizzare le comunità ittioplantoniche del Golfo di Napoli e Gaeta, utilizzando vari sistemi ci campionamento sia costiero che oceanico, e di creare modelli bio-fisici per predire il trasporto di uova e larve di pesci.

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• Titolo: La tassonomia integrata come mezzo per valutare la vera biodiversità del biota marino del Golfo di Napoli (Italia, Mar Mediterraneo)
  Tutor SZN: Fabio Crocetta
  Dipertimento: EMI

Descrizione:

Il Mar Mediterraneo è uno dei più importanti hotspot di biodiversità al mondo. Tuttavia, molti gruppi zoologici non sono mai stati soggetti ad una profonda revisione sulla base di metodologie moderne. Lo scopo del presente progetto sarà quello di studiare il biota del Golfo di Napoli attraverso un approccio di tassonomia integrata - e.g. un quadro completo per delimitare e descrivere i taxa integrando informazioni dal punto di vista ecologico, molecolare e morfologico. I dati ottenuti avranno implicazioni importanti per la conservazione delle specie, affineranno eventuali relazioni filogenetiche e faranno luce su linee evolutive e diversità criptica.

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• Titolo: Riconoscimento delle specie zoobentoniche dei fondi duri mesofotici ed estrazione di dati quali-quantitativi mediante analisi di immagine.
  Tutor SZN: Eva Salvati
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Riconoscimento delle specie zoobentoniche dei fondi duri mesofotici ed estrazione dati quali-quantitativi mediante analisi di immagine.

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• Titolo: Analisi delle microplastiche nelle aegagropile di Posidonia oceanica come indicatori di inquinamento marino

Tutor SZN: Valentina Costa, Cristina Pedà
Dipartimento: EMI, Calabria Marine Centre

Descrizione

Le aegagropile di Posidonia oceanica sono aggregati naturali che si formano a partire dalle fibre della fanerogama marina. Recenti studi hanno evidenziato il potenziale di questi aggregati nel trattenere e intrappolare microplastiche presenti nell’ambiente marino costiero.
Il tirocinio proposto si inserisce nel contesto delle ricerche sull’inquinamento da microplastiche negli ambienti costieri, con l’obiettivo di valutare la presenza, tipologia e abbondanza di frammenti plastici all'interno delle aegagropile raccolte lungo le coste del Mar Mediterraneo. Le attività previste includono la preparazione e digestione dei campioni in laboratorio, l’estrazione e l’osservazione delle microplastiche mediante stereomicroscopio, e la loro caratterizzazione.
Il progetto permetterà al/alla tirocinante di acquisire competenze nell’uso di protocolli per l’analisi di microplastiche da matrici naturali, nell’identificazione visiva e strumentale dei polimeri, e nella gestione e interpretazione dei dati ambientali.
Le attività di tirocinio si svolgeranno presso la sede SZN di Amendolara (Calabria Marine Centre).

•  Titolo: Tecniche di analisi spaziale su immagini da drone per il monitoraggio delle fanerogame marine

Tutor SZN: Valentina Costa
Dipartimento: EMI, Calabria Marine Centre

Descrizione

Le praterie di Posidonia oceanica rappresentano un habitat marino prioritario per la conservazione della biodiversità e la protezione delle coste. Il monitoraggio della loro estensione e stato di salute è fondamentale per valutarne la vulnerabilità e orientare le strategie di gestione e tutela. L’impiego di tecnologie aeree, come i droni, consente di raccogliere immagini ad alta risoluzione, utili per mappare e analizzare rapidamente vaste aree sommerse a costi contenuti.
Il tirocinio si concentrerà sull’analisi di immagini acquisite tramite drone durante campagne di monitoraggio su praterie di Posidonia oceanica in aree costiere del Mar Mediterraneo. Le attività previste includono: pretrattamento e georeferenziazione delle immagini, classificazione della copertura bentonica mediante software di analisi (es. QGIS), e stima di indicatori spaziali utili alla valutazione dello stato delle praterie (es. percentuale di copertura, frammentazione, bordi). Il/la tirocinante acquisirà competenze nell’elaborazione e interpretazione di dati spaziali, nell’uso di strumenti GIS e fotogrammetrici e nella gestione di dataset ambientali.
Le attività di tirocinio si svolgeranno presso la sede SZN di Amendolara (Calabria Marine Centre).

Biotecnologie Marine Ecosostenibili (BIOTECH):

• Titolo: Caratterizzazione funzionale del “pathway” di sintesi delle prostaglandine in microalghe marine:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

le prostaglandine sono molecole simili a secondi messaggeri e sono le molecole principalmente coinvolte nei processi infiammatori oltre che spesso anche nell’insorgenza di patologie gravi. La loro sintesi e la relativa via metabolica è stata recentemente scoperta anche in microalghe unicellulari eucariotiche marine. Capire il loro ruolo in organismi così semplici ed i meccanismi di regolazione funzionale aiuterà a decifrarne il ruolo sia ecologico che fisiologico oltre che l’importanza della loro conservazione nel corso dell’evoluzione del pianeta.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica e biologia molecolare; tecniche di coltura celluare; approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: microalghe marine (diatomee) e specie zooplanctoniche.

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• Titolo: Studio comparativo dell’enzima ciclo-ossigenasi (COX) in diverse specie di microalghe marine:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

Al fine di trasformare in applicazione biotecnologica la produzione delle prostaglandine tramite le microalghe marine, la caratterizzazione delle caratteristiche chimico fisiche e cinetiche dell’enzima necessario alla loro sintesi, la ciclo-ossigenasi, è determinante per preparare il terreno a future linee di ricerca applicative.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica e biologia molecolare.
Organismi utilizzati: batteri e microalghe marine (diatomee).

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• Titolo: Utilizzo di approcci bioinformatici per l’identificazione del “pathway” di sintesi delle prostaglandine in diversi organismi marini:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

Le prostaglandine sono molecole coinvolte nei processi infiammatori e patologici molto ben studiate nell’uomo. Molto interessante è stata considerata la loro produzione in semplici organismi marini quali le diatomee, alghe eucariotiche unicellulari. Considerato il forte interesse verso le risorse marine sia dal punto di vista ecologico che biotecnologico, è molto interessante espandere la loro ricerca in altri organismi marini per poi capirne il ruolo sia fisiologico che nella comunicazione chimica necessaria allo stabilirsi di un equilibrio fra le varie specie componenti il plankton. Le nuove tecnologie di sequenziamento affiancate da software bioinformatici risultano molto utili e versatili per poter eseguire uno studio ad ampio spettro.
Approcci utilizzati: approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: microalghe marine e specie zooplanctoniche.

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• Titolo: Approfondimenti molecolari dei “pathway” di sintesi di metaboliti secondari prodotti dalla diatomea Thalassiosira rotula:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

Le microalghe marine nel gruppo delle diatomee sono particolarmente interessanti per la produzione di metaboliti derivanti dal metabolismo secondario per l’adattamento alle diverse condizioni climatiche. Tali metaboliti svolgono principalmente funzione di difesa e pertanto hanno attività biologiche spesso interessanti per l’utilizzo umano in campo farmaceutico, nutraceutico e cosmeceutico. Thalassiosira rotula è una specie di diatomea presente nel Golfo di Napoli capace di sintetizzare alcuni metaboliti secondari interessanti. Il suo genoma e trascrittoma sono stati sequenziati permettendo così l’identificazione dei pathway responsabili della sintesi di tali metaboliti. Le sequenze ricavate dal sequenziamento genomico e trascrittomico permettono di approfondire l’attivazione di tali pathway in diverse condizioni tramite approcci molecolari.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica, biologia molecolare e biologia cellulare; tecniche di colture cellulari; approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: Thalassiosira rotula.

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• Titolo: Scoperta del potenziale farmacologico di microalghe marine contro l'attività della telomerasi nei tumori umani:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

I telomeri sono sequenze speciali situate all'estremità dei cromosomi il cui ruolo è la protezione delle estremità del DNA dai danni. Tuttavia, dopo ogni divisione cellulare la loro dimensione si riduce e quando la loro lunghezza raggiunge un punto critico, le cellule vanno incontro ad apoptosi e/o senescenza. Quindi, la lunghezza dei telomeri può rappresentare un orologio biologico per determinare la durata della vita di una cellula e di un organismo e la loro lunghezza è determinata da un enzima chiamato telomerasi. Questo enzima è costitutivamente spento nelle cellule somatiche, mentre è molto attivo nelle cellule germinali permettendo la loro continua replicazione. Allo stesso modo, la telomerasi è espressa in circa il 90% delle cellule tumorali, consentendo così la loro proliferazione indefinita. Per questo motivo, l'inibizione della telomerasi può rappresentare un target specifico preferito per le terapie antitumorali. Vari prodotti naturali, comunemente derivati da piante, hanno mostrato attività di inibizione della telomerasi e includono metaboliti secondari come polifenoli, alcaloidi, terpenoidi, xantoni e sesquiterpeni.
Le microalghe eucariotiche marine sono componenti molto importanti del fitoplancton in grado di adattarsi ad ogni tipo di nicchie ecologiche e condizioni fisico-chimiche a causa di una serie di metaboliti secondari che producono. Il progetto mira a identificare specie di microalghe che producono molecole in grado di inibire l'attività della telomerasi in un insieme di diverse linee cellulari tumorali per un possibile sfruttamento come farmaco antitumorale.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica, biologia molecolare e cellulare, approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: diatomee, dinoflagellati.

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• Titolo: Potenziale biotecnologico degli enzimi da diatomee
  Tutor SZN: Giovanna Romano
  Dipartimento: BIOTECH

Descrizione

Nel coso dell'evoluzione i microrganismi marini si sono progressivamente dotati di meccanismi di difesa e protezione per sostenere la vita in habitat caratterizzati da condizioni estreme di salinità, temperatura o pressione. I loro enzimi presentano quindi caratteristiche peculiari, ad es. termostabilità o alostabilità, che sono di rilevante interesse per applicazioni pratiche. Il progetto proposto si focalizzerà su lipasi e lipossigenasi dalle diatomee, poiché si prevedono nuove e utili funzionalità per applicazioni nell'industria alimentare, ad es. per migliorare la qualità degli impasti e per esaltare il sapore di prodotti alimentari (lipasi); nello sbiancamento di componenti colorati e nella produzione di composti aromatici (lipossigenasi).

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• Title: The Marine Diatom Odontella aurita as bioplastic manufacturer (DIAPLASTIKòS)

SZN Tutor: Clementina Sansone
Department: BluBiotech

Description

O. aurita - the only diatom species authorized as food complement in Europe - is a big cell size known to be rich in metabolites with highly variable solubilities (hydro- or lipophilic), such as lipids (PUFAs), carbohydrates (e.g., chrysolaminarin), vitamins (water- or fat-soluble) or carotenoids (fucoxanthin, diatoxanthin).
The general objective of DIAPLASTIKòS is to explore the strengths and weaknesses of the polymer production from the diatom O. aurita. Two main issues are considered: the intracellular synthesis of monomers, from metabolic understanding, improvement and the biosynthetic pathway, and the extraction steps for the polymerization.
Approaches used: Biochemistry, molecular biology, synthetic biology
Organisms used: Odontella aurita (marine diatom).

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• Titolo: La diatomea marina Odontella aurita come produttrice di bioplastiche (DIAPLASTIKòS)

SZN Tutor: Clementina Sansone
Dipartimento: BluBiotech

Descrizione

Odontella aurita, l'unica specie di diatomea autorizzata come integratore alimentare in Europa, è una cellula di grandi dimensioni nota per essere ricca di metaboliti con solubilità altamente variabile (idro- o lipofila), come lipidi (PUFA), carboidrati (ad esempio, crisolaminarina), vitamine (idrosolubili o liposolubili) o carotenoidi (fucoxantina, diatoxantina).
L'obiettivo generale di DIAPLASTIKòS è esplorare i punti di forza e di debolezza della produzione di polimeri dalla diatomea O. aurita. Vengono considerati due aspetti principali: la sintesi intracellulare dei monomeri, a partire dalla comprensione del pathway metabolico, dal miglioramento e dal percorso biosintetico, e le fasi di estrazione per la polimerizzazione.
Approcci utilizzati: Biochimica, biologia molecolare, biologia sintetica
Organismi utilizzati: Odontella aurita (diatomea marina).

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• Titolo: Odontella aurita as Diatom Cell Factory (DiCe_Fa)

SZN Tutor: Clementina Sansone-Christophe Brunet
Dipartimento: BluBiotech

Descrizione

La biomassa microalgale può svolgere un ruolo rilevante in ambito nutraceutico (ad esempio, alimenti funzionali, integratori alimentari), come la Spirulina fin dall'antichità. La diatomea marina Odontella aurita è l'unica diatomea appartenente all'elenco delle microalghe autorizzate dalla Commissione Europea come integratore alimentare. Questa caratteristica la rende un modello di diatomea rilevante e unico con un grande potenziale applicativo.
Questo progetto eseguirà un'analisi comparativa della bioattività e dei profili biochimici della biomassa ottenuta in condizioni di modulazione diversa della luce. Le proprietà bioattive e nutrizionali della biomassa di O. aurita saranno studiate su diverse linee cellulari che compongono e rivestono i tessuti e gli organi dell'apparato digerente. Abbiamo selezionato l'apparato digerente come target perché gli effetti nutrizionali possono essere valutati eseguendo l'analisi molecolare delle vie di segnalazione che si verificano nelle cellule coinvolte nelle reazioni metaboliche e nell'adsorbimento di bioattivi. Gli organoidi in vitro dell'apparato gastrointestinale saranno utilizzati per lo studio delle proprietà nutrizionali e della cinetica di assorbimento della biomassa di O. aurita. Lo studente studierà le relazioni funzionali tra la composizione dei composti bioattivi nella biomassa intera e il potenziale aumento/diminuzione delle proprietà benefiche dopo digestione enzimatica gastrica. Verranno utilizzate tecniche biomolecolari avanzate per valutare il destino cellulare, saggi enzimatici o saggi cellulari in vitro. Lo studente sarà coinvolto in tutte le fasi del lavoro, dalla manipolazione della biomassa dopo la crescita di O. aurita ai saggi su linee cellulari eucariotiche e organoidi appartenenti all'apparato gastro-digestivo.
Approcci utilizzati: Biochimica, biologia molecolare, biologia sintetica
Organismi utilizzati: Odontella aurita (diatomea marina), modelli in vitro di cellule eucariotiche.

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• Titolo: Isolamento e Screening di batteri da seamounts marini e potenziale biotecnologico

Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

Gli approcci di studio della frazione microbica coltivabile costituiscono una strategia complementare ai metodi molecolari per la comprensione delle potenzialità dei microrganismi, soprattutto in ambienti marini peculiari poco esplorati.
Il progetto di ricerca avrà come obiettivo l’isolamento di ceppi batterici da campioni di acqua prelevati in seamounts marini, con particolare focus su batteri in grado di tollerare metalli pesanti e contaminanti emergenti. L’attività prevede la preparazione di terreni di coltura (selettivi/non selettivi), l’isolamento dei ceppi batterici, lo screening della tolleranza ai contaminanti e l’esplorazione del loro potenziale biotecnologico. Lo studio prevede inoltre l’impiego di tecniche molecolari per l’identificazione tassonomica.
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• Titolo: Screening di batteri estremofili per la produzione di biosurfattanti e potenziale in strategie di bioremediation

Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

I biosurfattanti sono composti tensioattivi di origine naturale di grande interesse scientifico come valide alternative ai surfattanti chimici. I microrganismi isolati da ambienti estremi, compresi ambienti altamente contaminati, sono promettenti nell’ambito della biodiscovery, perché ancora poco investigati.
Il progetto di ricerca avrà come obiettivo lo screening di un panel di ceppi microbici tolleranti ai metalli pesanti per la produzione di biosurfattanti, e l’esplorazione nell’ambito della rimozione dei metalli da matrici acquose. L’attività prevede la preparazione di terreni di coltura, l’esecuzione di test di tolleranza ai metalli pesanti, l’esecuzione di test di screening specifici e l’estrazione dei biosurfattanti. Lo studio prevede inoltre l’esecuzione di esperimenti di bioremediation.
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• Titolo: Studio di comunità microbiche associate a invertebrati marini che popolano gli ambienti bentonici delle Maldive

Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

Le Maldive, un arcipelago nell'Oceano Indiano, sono uno dei più importanti hotspot di biodiversità al mondo, basata su importanti ecosistemi bentonici, come le barriere coralline e le praterie di fanerogame marine. Questi ecosistemi sensibili hanno dovuto affrontare vari fattori di stress antropogenici, tra cui l'inquinamento marino da plastica.
Il progetto mira a indagare la presenza di microplastiche nelle specie bentoniche sensibili e a studiare le comunità microbiche associate per decifrare come queste siano influenzate dalla presenza di microplastiche. L’attività prevede lo studio delle comunità con duplice approccio: caratterizzazione tassonomica delle comunità associate tramite tecniche di sequenziamento avanzato, e l’impiego di approccio colturale per l’isolamento di batteri simbionti e i test di tolleranza a plastiche e contaminanti associati.
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Biologia ed Evoluzione degli Organismi Marini (BEOM):

• Titolo: Interazione ospite-microbiota: esplorando l’asse intestino-cervello negli invertebrati marini

Tutor SZN: Assunta Liberti
Dipartimento: BEOM

Descrizione

Le interazioni ospite-microorganismi nel tratto gastrointestinale sono fondamentali per un corretto sviluppo e funzionamento dell’organismo ospite. In particolare, la comunicazione bidirezionale che si stabilisce tra intestino e cervello gioca un ruolo chiave, con il microbiota capace di influenzare anche il comportamento dell’ospite. L’obiettivo di questo progetto formativo è di investigare negli invertebrati marini, quali protocordati e molluschi, le componenti del sistema immunitario e nervoso enterico, analizzando le loro variazioni in seguito alla manipolazione della comunità microbica isolati da essi. Questo studio fornirà le basi per futuri studi funzionali e comportamentali, ampliando la comprensione del legame tra microbiota, immunità e neurofisiologia negli invertebrati marini.

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• Titolo: Plasticità neuronale in molluschi marini: il ruolo dei mitocondri

Tutor SZN: Serena Mirra
Dipartimento: BEOM

Descrizione

Lo studio è finalizzato ad elucidare i meccanismi di resilienza neuronale contro stress ambientali in molluschi marini, con focus particolare sull’omeostasi mitocondriale (dinamiche, funzione, bioenergetica), l’autofagia, la morte cellulare e le risposte infiammatorie.

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• Titolo: Sviluppo di un atlante digitale del cervello di Octopus vulgaris
  Tutor SZN: Graziano Fiorito
  Dipartimento: BEOM

Descrizione

Sulla base dell'analisi di studi pubblicati e di risorse interne (disponibili presso l'octopus lab, Dipartimento Biologia ed Evoluzione degli Organismi Marini - BEOM, Stazione Zoologica) si prevede di sviluppare l'annotazione di sezioni seriali dell'intero cervello di polpo adulto, integrando dati sulla struttura ed organizzazione neurale, con rappresentazione digitale delle singole aree e regioni di interesse. Il prodotto atteso prevede applicazione dei principi FAA (flexible annotation atlas) e implementazione dei FAIR Data Principles. Il contributo finale atteso aiuterà a migliorare la coerenza della definizione di regioni di interesse dell'intero cervello di cefalopodi tra i laboratori a livello internazionale.

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Biotecnologie Marine Ecosostenibili (BIOTECH):

• Titolo: Isolamento e caratterizzazione di microalghe da siti ad elevato impatto antropico

Tutor: Lucia Barra
Dipartimento: BLUBIO, sede Calabria

Descrizione

Le attività prevederanno il campionamento di acqua di mare e sedimento in siti ad elevata presenza di contaminanti quali metalli ed idrocarburi, e loro arricchimento per l’isolamento di specie con utilizzo della metodologia a capillare e diluizioni seriali.  La frazione eucariotica fotosintetizzante sarà geneticamente caratterizzata attraverso marcatori molecolari già pubblicati o di nuovo design. La costruzione di alberi filogenetici con le sequenze delle specie ottenute metterà in relazione da un punto di vista evolutivo le comunità identificate.

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• Titolo: Valutazione della risposta fisiologica microalgale in presenza di metalli

Tutor: Lucia Barra 
Dipartimento: BLUBIO, sede Calabria

Descrizione

Lo studente valuterà la risposta della crescita di differenti specie di microalghe, isolate da zone altamente impattate, in presenza di metalli tossici quali zinco, piombo, cadmio, mercurio e cromo III-VI, sia rispetto al singolo metallo che a mix degli stessi. Le risposte delle specie saranno categorizzate in letale-subletale-tollerante-resistente e l’analisi della frazione adsorbita e/o accumulata sarà condotta tramite la tecnologia dell’ICP-MS. La costituzione di consorzi algali che lavorano in sinergia sarà la finalità dello studio condotto.

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• Titolo: Caratterizzazione funzionale del “pathway” di sintesi delle prostaglandine in microalghe marine:

SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

Le prostaglandine sono molecole simili a secondi messaggeri e sono le molecole principalmente coinvolte nei processi infiammatori oltre che spesso anche nell’insorgenza di patologie gravi. La loro sintesi e la relativa via metabolica è stata recentemente scoperta anche in microalghe unicellulari eucariotiche marine. Capire il loro ruolo in organismi così semplici ed i meccanismi di regolazione funzionale aiuterà a decifrarne il ruolo sia ecologico che fisiologico oltre che l’importanza della loro conservazione nel corso dell’evoluzione del pianeta.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica e biologia molecolare; tecniche di coltura celluare; approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: microalghe marine (diatomee) e specie zooplanctoniche.

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• Titolo: Studio comparativo dell’enzima ciclo-ossigenasi (COX) in diverse specie di microalghe marine
  SZN Tutor: Valeria Di Dato
  Department: BluBiotech

Descrizione

Al fine di trasformare in applicazione biotecnologica la produzione delle prostaglandine tramite le microalghe marine, la caratterizzazione delle caratteristiche chimico fisiche e cinetiche dell’enzima necessario alla loro sintesi, la ciclo-ossigenasi, è determinante per preparare il terreno a future linee di ricerca applicative.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica e biologia molecolare.
Organismi utilizzati: batteri e microalghe marine (diatomee).

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• Titolo: Utilizzo di approcci bioinformatici per l’identificazione del “pathway” di sintesi delle prostaglandine in diversi organismi marini
  SZN Tutor: Valeria Di Dato
  Department: BluBiotech

Descrizione:
Le prostaglandine sono molecole coinvolte nei processi infiammatori e patologici molto ben studiate nell’uomo. Molto interessante è stata considerata la loro produzione in semplici organismi marini quali le diatomee, alghe eucariotiche unicellulari. Considerato il forte interesse verso le risorse marine sia dal punto di vista ecologico che biotecnologico, è molto interessante espandere la loro ricerca in altri organismi marini per poi capirne il ruolo sia fisiologico che nella comunicazione chimica necessaria allo stabilirsi di un equilibrio fra le varie specie componenti il plankton. Le nuove tecnologie di sequenziamento affiancate da software bioinformatici risultano molto utili e versatili per poter eseguire uno studio ad ampio spettro.
Approcci utilizzati: approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: microalghe marine e specie zooplanctoniche.
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• Titolo: Approfondimenti molecolari dei “pathway” di sintesi di metaboliti secondari prodotti dalla diatomea Thalassiosira rotula
  SZN Tutor: Valeria Di Dato
  Department: BluBiotech

Descrizione

Le microalghe marine nel gruppo delle diatomee sono particolarmente interessanti per la produzione di metaboliti derivanti dal metabolismo secondario per l’adattamento alle diverse condizioni climatiche. Tali metaboliti svolgono principalmente funzione di difesa e pertanto hanno attività biologiche spesso interessanti per l’utilizzo umano in campo farmaceutico, nutraceutico e cosmeceutico. Thalassiosira rotula è una specie di diatomea presente nel Golfo di Napoli capace di sintetizzare alcuni metaboliti secondari interessanti. Il suo genoma e trascrittoma sono stati sequenziati permettendo così l’identificazione dei pathway responsabili della sintesi di tali metaboliti. Le sequenze ricavate dal sequenziamento genomico e trascrittomico permettono di approfondire l’attivazione di tali pathway in diverse condizioni tramite approcci molecolari.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica, biologia molecolare e biologia cellulare; tecniche di colture cellulari; approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: Thalassiosira rotula.

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Titolo: Scoperta del potenziale farmacologico di microalghe marine contro l'attività della telomerasi nei tumori umani
SZN Tutor: Valeria Di Dato
Department: BluBiotech

Descrizione

I telomeri sono sequenze speciali situate all'estremità dei cromosomi il cui ruolo è la protezione delle estremità del DNA dai danni. Tuttavia, dopo ogni divisione cellulare la loro dimensione si riduce e quando la loro lunghezza raggiunge un punto critico, le cellule vanno incontro ad apoptosi e/o senescenza. Quindi, la lunghezza dei telomeri può rappresentare un orologio biologico per determinare la durata della vita di una cellula e di un organismo e la loro lunghezza è determinata da un enzima chiamato telomerasi. Questo enzima è costitutivamente spento nelle cellule somatiche, mentre è molto attivo nelle cellule germinali permettendo la loro continua replicazione. Allo stesso modo, la telomerasi è espressa in circa il 90% delle cellule tumorali, consentendo così la loro proliferazione indefinita. Per questo motivo, l'inibizione della telomerasi può rappresentare un target specifico preferito per le terapie antitumorali. Vari prodotti naturali, comunemente derivati da piante, hanno mostrato attività di inibizione della telomerasi e includono metaboliti secondari come polifenoli, alcaloidi, terpenoidi, xantoni e sesquiterpeni.
Le microalghe eucariotiche marine sono componenti molto importanti del fitoplancton in grado di adattarsi ad ogni tipo di nicchie ecologiche e condizioni fisico-chimiche a causa di una serie di metaboliti secondari che producono. Il progetto mira a identificare specie di microalghe che producono molecole in grado di inibire l'attività della telomerasi in un insieme di diverse linee cellulari tumorali per un possibile sfruttamento come farmaco antitumorale.
Approcci utilizzati: tecniche di biochimica, biologia molecolare e cellulare, approcci bioinformatici.
Organismi utilizzati: diatomee, dinoflagellati.

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• Titolo: Screening per la produzione di biomolecole con proprietà antibiofilm

Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

Screening di isolati batterici marini per attività antimicrobica e produzione di molecole bioattive con attività inibitoria della formazione di biofilm di ceppi patogeni. Applicazione di approccio colturale e tecniche molecolari per identificazione tassonomica.

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• Titolo: Estrazione di chitina e chitosano da scarti della pesca

Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

Isolamento di prodotti di alto valore da specie marine sottoutilizzate e da rifiuti provenienti da impianti di lavorazione del pesce e di acquacoltura in un'ottica di economia circolare e di riciclo.

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• Titolo: Caratterizzazione di comunità microbiche associate a microplastiche in ambiente marino
Tutor SZN: Carmen Rizzo
Dipartimento: BLUEBIO, Sicily Marine Centre, Messina

Descrizione

Approccio colturale e molecolare per lo studio delle comunità microbiche associate a microplastiche (plastisfera) e applicazioni biotecnologiche per il potenziale degradativo.

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Ecologia Marina Integrata (EMI):

• Titolo: Valutazione dell’inquinamento da plastiche in aree del Mar Mediterraneo ed approccio allo studio del potenziale trasferimento di microplastiche nella catena trofica
  Tutor SZN: Cristina Pedà
  Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione:

L'impatto dei rifiuti marini, in particolare della plastica, sulla vita e sugli habitat marini rappresenta una delle principali preoccupazioni a livello globale nonché una importante questione ambientale. Le microplastiche (< 5 mm) sono la categoria dimensionale più frequentemente rilevata in ambiente marino ed anche nei tratti gastrointestinali dei vertebrati marini poiché esse possono facilmente entrare nella rete trofica attraverso l'ingestione diretta o indiretta. Ad oggi, molti studi hanno investigato l'ingestione di microplastiche e di contaminanti chimici associati negli organismi marini, ma il loro trasferimento attraverso la rete trofica è poco conosciuto, soprattutto ai livelli trofici più alti. Le attività di tirocinio si concentrerà sullo studio della presenza di plastica in aree del Tirreno meridionale attraverso l’applicazione di protocolli di estrazione di plastiche e microplastiche da diverse matrici (acqua, sedimenti, biota). Inoltre, le attività prevedono anche lo studio dell’ingestione di microplastiche da parte di specie chiave della catena trofica dello Stretto di Messina, attraverso l’analisi del contenuto stomacale, utilizzando sia l’approccio della digestione chimica che del visual sorting. L’identificazione e la caratterizzazione delle plastiche e microplastiche verrà effettuata mediante spettroscopia infrarossa in trasformata di Fourier (FTIR). L’attività di tirocinio verrà svolta presso la sede SZN di Messina (Sicily Marine Centre).

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• Titolo: Studio dell’impatto di microplastiche in ambienti polari
  Tutor SZN: Cristina Pedà
  Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione

L'inquinamento da rifiuti marini colpisce anche ambienti remoti come le regioni artiche e la loro biodiversità. Tuttavia, a causa dell'inaccessibilità e della difficoltà di osservazioni costanti in questi ambienti, sono necessari ulteriori studi per colmare le lacune di conoscenza. L’attività di tirocinio si concentrerà sullo studio dell’impatto della plastica in campioni raccolti in aree polari attraverso l’applicazione di protocolli di estrazione di plastiche e microplastiche da matrici ambientali (acqua, sedimenti, biota). L’identificazione e la caratterizzazione delle plastiche verrà effettuata mediante spettroscopia infrarossa in trasformata di Fourier (FTIR). L’attività di tirocinio verrà svolta presso la sede SZN di Messina (Sicily Marine Centre).

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• Titolo: Aspetti biologici ed ecologici di teleostei di ambienti profondi 

Tutor SZN: Pietro Battaglia
Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione

Le conoscenze sui pesci degli ambienti profondi del Mar Mediterraneo sono ancora poco approfondite. Lo scopo del presente progetto sarà quello di investigare alcuni aspetti ecologici e biologici di specie ittiche, tra cui l’accrescimento, l’età, la maturità sessuale, le abitudini alimentari. Il tirocinante acquisirà conoscenze sulla tassonomia delle specie ittiche e sulle metodiche comunemente utilizzate per la valutazione dei suddetti aspetti. I risultati forniranno una baseline per eventuali politiche di gestione e conservazione delle specie. L’attività verrà svolta presso il Laboratorio di Ittiologia e Pesca della sede SZN di Messina (Sicily Marine Centre).

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• Titolo: ecologia trofica di molluschi cefalopodi 

Tutor SZN: Pietro Battaglia e Giorgio Aglieri
Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione

Il progetto CIAO MARE utilizza alcune specie di molluschi cefalopodi, con differente ecologia e stile di vita, come bioindicatori dello stato ambientale del mare, indagando sugli effetti di inquinamento e rifiuti marini sulla biologia, la fisiologia, l'ecologia e la qualità della carne di queste risorse alieutiche. In questo contesto, vengono studiate le abitudini alimentari di seppia, polpo e calamaro attraverso un approccio integrato che vede l’impiego di diverse tecniche complementari: analisi di contenuti stomacali, analisi isotopiche e metabarcoding. L’attività di tirocinio verrà svolta presso il Laboratorio di Ittiologia e Pesca della sede SZN di Messina (Sicily Marine Centre).

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• Titolo: valutazione dell’impatto dell’ingestione di microplastiche nei molluschi cefalopodi 

Tutor SZN: Pierpaolo Consoli
Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre 

Descrizione

L'impatto delle attività umane ha conseguenze significative sul biota marino e sull'ambiente, a causa della presenza di diversi inquinanti chimici e rifiuti marini, tra cui le microplastiche. L’attività di tirocinio si concentrerà sullo studio dell’ingestione di microplastiche da parte di molluschi cefalopodi, attraverso l’analisi del tratto gastro-intestinale, utilizzando l’approccio della digestione chimica e l’identificazione e la caratterizzazione dei composti mediante spettroscopia infrarossa in trasformata di Fourier (FTIR). L’attività di tirocinio verrà svolta presso la sede SZN di Messina (Sicily Marine Centre).

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• Titolo: Studi di tassonomia integrata in invertebrati marini
  Tutor SZN: Laura Nunez Pons
  Dipartimento: EMI

Descrizione

Ricerca basata nella classificazione degli invertebrati marini applicando tecniche per la diagnosi e descrizione morfologica delle specie, e approcci molecolari di DNA barcoding e filogenesi.

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• Titolo: Allelopatia e simbiosi funzionale in olobioti marini
  Tutor SZN: Laura Nunez Pons
  Dipartimento: EMI

Descrizione

Studi relazionati con le interazioni simbiotiche negli ecosistemi marini e suo ruolo nella salute degli organismi, le malattie e l’acclimatazione a cambiamenti ambientali attraverso flussi metabolici di nutrienti, composti di difesa e mediatori allelochimici.

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• Titolo: La tassonomia integrata come mezzo per valutare la vera biodiversità del biota marino del Golfo di Napoli (Italia, Mar Mediterraneo)
  Tutor SZN: Fabio Crocetta
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

Il Mar Mediterraneo è uno dei più importanti hotspot di biodiversità al mondo. Tuttavia, molti gruppi zoologici non sono mai stati soggetti ad una profonda revisione sulla base di metodologie moderne. Lo scopo del presente progetto sarà quello di studiare il biota del Golfo di Napoli attraverso un approccio di tassonomia integrata - e.g. un quadro completo per delimitare e descrivere i taxa integrando informazioni dal punto di vista ecologico, molecolare e morfologico. I dati ottenuti avranno implicazioni importanti per la conservazione delle specie, affineranno eventuali relazioni filogenetiche e faranno luce su linee evolutive e diversità criptica.

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• Titolo: Megabenthos di acque profonde del Mediterraneo Centrale
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI
  
  Descrizione:

Lo studio mira a creare un inventario della fauna megabentonica profonda del Mediterraneo Centrale, combinando l'analisi video con l'approccio morfologico/molecolare del materiale campionato.

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• Titolo: Monitoraggio di microcosmi in ambiente controllato
  Tutor SZN: Frine Cardone
  Dipartimento: EMI

Descrizione:

La ricerca mira a valutare le prestazioni di allevamento in acquario di "minicomunità" mediante il monitoraggio a medio termine dei parametri morfometrici.

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• Titolo: Risposte di comunità in contesti di multiple stressors
  Tutor SZN: Manuel Berlino, Maria Cristina Mangano
  Dipartimento: EMI, Sicily Marine Centre

Descrizione:

Gli habitat bentonici ospitano un’elevata biodiversità e svolgono un ruolo fondamentale nel flusso di energia, nel ciclo del carbonio e nel mantenimento del funzionamento degli ecosistemi marini. Comprendere come le comunità bentoniche rispondono a diversi fattori di disturbo è quindi essenziale per la conservazione dell’ambiente marino.
Il progetto utilizza un approccio ecosistemico per valutare i pattern di disturbo associati a diversi stressor, attraverso la misurazione di variabili abiotiche e l’analisi della biodiversità in aree costiere e profonde. Particolare attenzione sarà rivolta ai processi metabolici, alle variazioni della diversità tassonomica e funzionale e alle relazioni con il funzionamento ecosistemico.

Il/la tirocinante supporterà le diverse fasi della ricerca, partecipando a:
• attività di campionamento
• analisi dei campioni in laboratorio
• estrazione e gestione dei dati raccolti

Profilo:
Laurea in Scienze biologiche, ambientali o naturali (o titolo equivalente); conoscenza della lingua inglese; esperienza di lavoro sul campo (marino) e in laboratorio biologico; conoscenze di base sui cicli biogeochimici degli ambienti marini; disponibilità a trasferte per attività di campionamento.

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Conservazione degli Animali marini e Public Engagement (CAPE):

• Titolo: schedatura catalografica di documenti dell’Archivio Storico tramite software Archiui
  Tutor SZN: Andrea Travaglini
  Dipartimento: CAPE

Descrizione

Tirocinio curriculare da svolgere presso l’Archivio Storico della Stazione Zoologica Anton Dohrn, riservato agli studenti dell’Università di Napoli L’Orientale. Requisiti richiesti: lettura e comprensione del documento storico, in varie lingue; trattamento dei dati testuali in forma automatica. Attività: partecipare alla catalogazione di un lotto selezionato di documenti (come lettere, registri) tramite il software Archiui. Nello specifico, il tirocinante dovrà occuparsi di una o di alcune delle seguenti attività: segnatura (inserimento di un codice alfanumerico progressivo); schedatura (campi obbligatori secondo standard archivistici); descrizione o regesto; key words (creazione di relazioni tra i documenti). Obiettivi: acquisizione delle conoscenze e competenze tecnologiche in archivistica contemporanea, relative alla trasformazione di un archivio storico scientifico, da cartaceo a ibrido.

Per ulteriori informazioni e disponibilità, contattare: Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.

Infrastrutture di ricerca per le risorse biologiche marine (RIMAR):

• Titolo: Progettazione, costruzione e collaudo di strumentazione per la ricerca negli ambienti marini
  Tutor SZN: Simonepietro Canese
  Dipertimento: RIMAR

Descrizione:

La Stazione Zoologica Anton Dohrn è alla ricerca di uno studente di ingegneria industriale per uno stage estivo nel nostro dipartimento di infrastrutture di ricerca. La data di inizio e il programma dello stage sono
flessibili, ma stiamo cercando studenti che possano impegnare da 30 a 40 ore settimanali per un periodo da 10 a 12 settimane.
Funzioni essenziali: Progettazione, costruzione e collaudo di strumentazione per la ricerca negli ambienti marini;

Per ulteriori informazioni e disponibilità, contattare: Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.

Decreto del Presidente n. 114 del 20.10.2021: Elezioni dei membri del Consiglio dei Dipartimenti: risultato elezione rappresentante del Personale Associato dell'Ente

Decreto del Presidente n. 95 del 08/09/2021: Elezioni dei membri del Consiglio dei Dipartimenti: sostituzione del Rappresentante del Personale Associato dell’Ente

Le candidature dovranno essere inviate a Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo. entro le ore 12.00 del giorno 21/09/2021.

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SCADUTO - Elezione Rappresentante dei dottorandi e dei postdoc/assegnisti dell'ENTE

Decreto del Presidente n. 77 del 13/07/2021: Risultato Elezioni dei membri del Consiglio dei Dipartimenti: sostituzione del Rappresentante dei dottorandi e dei postdoc/assegnisti dell’Ente

Decreto del Presidente n. 71 del 18/06/2021: Elezioni dei membri del Consiglio dei Dipartimenti: sostituzione del Rappresentante dei dottorandi e dei postdoc/assegnisti dell’Ente

Portale SZN appalti telematici

Il laboratorio di Microscopia è dotato di attrezzature per l'osservazione iniziale dei microbi (diagnostica diretta) in sospensione o su substrato e per la loro identificazione, preliminare o definitiva.

Responsabile: Ulisse Cardini ulisse.cardini(at)szn.it Interno #303

Per prenotazioni rivolgersi al Responsabile

Strumentazione disponibile Microscopio a epifluorescenza con telecamera Zeiss AxioSkop Microscopio a fluorescenza con telecamera Zeiss AxioZoom Centrifuga Biofuge per eppendorfs Fornetto per incubazioni di CARD-FISH

Il laboratorio di Citometria a flusso è dotato di attrezzature per la rilevazione, il conteggio e la caratterizzazione di microorganismi in sospensione sulla base di proprietà ottiche (scatter e fluorescenza). Vi si realizza anche la preparativa e prelievi ancillari (filtrazioni, dissezione, etc.).

Responsabile: Ulisse Cardini ulisse.cardini(at)szn.it Interno #303

Per prenotazioni rivolgersi al Responsabile

Strumentazione disponibile Citometro FACScalibur BD BioSciences Citometro Accuri C6 con modulo onCyt Citometro CytoSense da banco

Il laboratorio di Geomicrobiologia è dotato di attrezzature per lo studio dei processi microbici che condizionano i cicli biogeochimici. La strumentazione disponibile permette il mantenimento di colture, la preparazione di campioni per incubazioni e la loro analisi per composizione chimica, alcalinità totale e gas disciolti.

Responsabile: Ulisse Cardini ulisse.cardini(at)szn.it Interno #303

Per prenotazioni rivolgersi al Responsabile

Strumentazione disponibile Cella termostatata con illuminazione Sistema per la titolazione automatica Metrohm Respirometro portatile subacqueo CISME Presto disponibili Spettroscopia infrarossa di trasformata di Fourier Cella termostatata senza illuminazione Spettrometro di massa a membrana semipermeabile

ISSNP virtual school: 6th – 8th July 2021

We are glad to announce the 4th edition of the “International Summer School of Natural Products” (ISSNP)

As we are still experiencing Covid19-related restrictions, this edition will switch from physical to virtual school.

The school is designed for PhD students and young researchers and aimed to build up a lively scientific community tackling global challenges in the field of natural products.

Strategical objectives will be focused on interdisciplinary and intersectoral learning, networking and cross collaborations.

A combination of lectures, seminars and interactive sessions will provide an immersive and challenging experience and team-based problem-solving activities will help the participants to be prepared for future research studies in these fields

Applicants will learn from top scientists and professionals

In order to become a leader yourself, it is very important to learn from leaders. ISSNP attracts experts who are typically busy and rarely available during the academic year.

Applicants will be able to network with like-minded colleagues.

ISSNP is built around specific themes and targets students and researchers who have an interest in and enthusiasm for this special subject, Natural Products. Networks will be constructed throughout the 3 days of school activities, during lectures, seminars and interactive sessions, working in-group.

Positive aspects of Virtual Meetings:

• Meeting recordings ensure nothing goes lost
• You can meet on the go from your phone
• You can join from your favourite place
• You can create new workflows
• You can still talk face to face
• It’s easy to collaborate with screen sharing
• A big community online is even bigger

Registration
To register visit to the Registration Page for the IV Edition of the International Summer School on Natural Products (ISSNP) at https://www.issnpschool.org/registration/

The programme will be available at the link: issnpschool.org/programme/
Further information is available at the school website: https://www.issnpschool.org/school/

“BIAGIO ALBERTO DELLA BEFFA” PRIZE

On the occasion of the 100th Anniversary of its foundation, Indena (www.indena.com), in partnership with the International Summer School of Natural Products ISSNP, is pleased to announce the institution of a biennial prize dedicated to the memory of its founder “Biagio Alberto Della Beffa.”

For the first edition of the “Biagio Alberto Della Beffa” Prize, three contest winners will be selected among the next International Summer School of Natural Product edition participants. The prize aims to award and support the professional development of young talented scientists in Natural Product Chemistry.

The prize is directed to Chemists, Pharmacists, and Pharmaceutical Chemists who obtained their MSc after 2018 and are currently attending the 2nd/3rd year of a PhD related to Chemistry and Pharmaceutical Sciences.

The three winners will be awarded a Grant of 5.000,00 €, and they will benefit of a 6-month internship at Indena’s premises, that includes a Managerial course.

The prize will be awarded during the International Summer School on Natural Products, organized among the 6th and the 8th July 2021, signifying a closer collaboration between Industry and Academia.
Kindly feel free to contact us (Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.) for any further queries.

Scientific committee

Valeria COSTANTINO, President (Università degli Studi di Napoli Federico II)
Alessia CASO (Università degli Studi di Napoli Federico II)
Adele CUTIGNANO (Istituto di chimica biomolecolare, CNR)
Gerardo Della Sala (Stazione Zoologica, Anton Dohrn)
Germana ESPOSITO (Università degli Studi di Napoli Federico II)
Gabriele FONTANA (Indena)
Roberta MARCHETTI (Università degli Studi di Napoli Federico II)
Luigi MILELLA (Università degli Studi della Basilicata)
Alberto MINASSI (Università degli Studi del Piemonte Orientale)
Maria Chiara MONTI (Università degli Studi di Salerno)
Mattia MORI (Università degli Studi di Siena)
Vera MUCCILLI (Università degli Studi di Catania)
Giorgia OLIVIERO (Università degli Studi di Napoli Federico II)
Daniele PASSARELLA (Università degli Studi di Milano)
Giovanna ROMANO (Stazione Zoologica, Anton Dohrn)
Valentina SEPE (Università degli Studi di Napoli Federico II)

Advisory Board

William GERWICK (Department of Biology and Marine Biology and Center for Marine Science, UNCW)
Mark BRÖNSTRUP (Centre for Drug Research, Faculty of Pharmacy, University of Helsinki)
Patrícia VALENTÃO (Faculty of Pharmacy, University of Porto).