La ricerca alla Stazione Zoologica Anton Dohrn si svolge come segue:
Laboratori di Ricerca (Fisiologia Animale ed Evoluzione, Biologia Cellulare e dello Svilippo, Ecologia ed Evoluzione del Plancton, Ecologia Funzionale e Evolutiva)
Servizi di supporto per la ricerca (Allevamento Organismi Marini, Biologia Molecolare, Tassonomia e Identificazione del Fitoplancton Marino, Tecnologie per lo Studio dell'Espressione Genica)
Gestione Ambiente ed Ecologia Costiera
Acquariologia
